通信工程专业自2006年9月经上海市教委批准后开始面向全国招生， 2022年获批上海市一流学科建设专业建设点。 本专业贯彻学校航天航空特色的办学方略，以飞行器控制与信息工程中融合通信技术为建设方向，紧密围绕航电信息的产业应用需求，实现基于现代通信技术的飞行器相关控制理论与信息科学交叉。

专业以现代航空科学与信息工程体系为主干组织教学， 重点建设雷达、导航、多传感器融合通信等特色领域，并致力于培养具备空天通信系统控制与信息处理能力的复合型人才。在此基础上，专业已牵头开设“无人机应用技术”微专业，不断拓展航空电子、控制、信息等领域基础知识与专业技能，推进航空航天、国防科技及低空经济等领域的信息化通信类人才建设。