工业工程专业是2005年经上海市教委批准开设的本科专业，2006年秋季开始面向全国招生。2009年6月通过上海市教委新专业检查。2010年6月通过上海市人民政府学位办公室学士学位授予权的评审。2025年与质量管理工程专业合并，按工业工程大类招生，同时开设卓越质量班（或质量方向班）。